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学术报告

基于深度学习的单细胞聚类与标注 – 邓明华 教授 (北京大学)

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报告题目:基于深度学习的单细胞聚类与标注

报告人:邓明华 教授(北京大学)

时间:2021年12月8日(星期三)下午16:00-17:00

地点:线下:教二楼309

          线上腾讯会议ID:462 809 547

摘要:本报告将汇报本课题组近期在单细胞RNA-Seq数据分析上的两个工作ScziDesk和ScSemiCluster。单细胞RNA-Seq技术现在成为了生物学研究的基本手段,但其高噪声和稀疏性为数据分析带来了挑战。细胞聚类和细胞标注是单细胞测序数据分析的最基本任务,我们融合聚类和基于深度学习的非线性降维方法,开发了聚类方法scziDesk;进一步结合领域适应(Domain Adaptation)方法,开发了细胞标注方法scSemiCluster,模拟数据和实际数据分析表明了算法的有效性。

报告人简介:邓明华,北京大学77779193永利官网教授。1987年9月-1998年1月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究工作,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学医学院流行病与公共卫生系访问副教授。已发表SCI论文80余篇。曾先后主持5项自然科学基金面上项目和1项863项目,参加3项973项目和1项科技部重点研发项目。

主办单位:北京国家应用数学中心

                首都师范大学交叉科学研究院、77779193永利官网

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